Mikrobiologi adalah cabang dari disiplin ilmu biologi yang mempelajari makhluk hidup (organisme) yang terlalu kecil untuk dilihat dengan mata telanjang. Objek penelitian adalah semua makhluk (hidup) yang perlu dilihat di bawah mikroskop, terutama bakteri, fungi, alga mikroskopis, protozoa, dan Archaea. Virus juga sering dimasukkan, meski nyatanya tidak bisa sepenuhnya dianggap makhluk hidup.
